跨境电子商务是指不同国家或地区的个人与企业，通过跨境电子商务平台达成交易、进行支付结算，并通过跨境物流送达商品、完成交易的一种国际商业活动。跨境电子商务贸易一般包括B2B、B2C、保税区B2B2C等方式。
相较于传统贸易形式，跨境电子商务具有批次多、批量小、品种杂、货值低等特点，给中国消费者带来了便利与实惠的同时，也给跨境电商负面清单检疫工作带来了诸如监管模式被突破等新的挑战。作为跨境贸易活动监督管理的主要官方部门之一，跨境电商负面清单检疫部门如何发挥职能，是站在时代变革之际的检验检疫人需要积极应对的问题。
跨境电商负面清单检疫主要职能就是防止人类传染病、动植物病虫害跨境传播，防止不安全不合格产品进出口。与此相应的，检验检疫环节必须在销售和使用之前完成，其时间特性也决定了无法为便利国内消费者作出相应让步。为了应对跨境电子商务“进口卡在国检”的传言，国内多地检验检疫机构出台了相应的检验检疫监督管理办法，从监管模式上进行改革，谋求突破。
总之，面对跨境电子商务跨越式发展的新局势，检验检疫的改革和调整十分迫切。目前跨境电子商务的检验检疫监管缺少国家性的法规文件支持，各地出台的都是地方性的管理办法，做法不一导致监管局面混乱，如何制定新的监管模式，满足风险防控的要求，同时又保障或最大限度的不影响跨境电子商务的便利，是摆在检验检疫人面前的重大课题。
